ПЦР может дать ложно-положительный результат. Так что не заморачивайтесь.
По поводу гарденелл - у Вас анализы положительные - есть эти бактерии? Если нет - самолечением заниматься категорически не советую.
Если подругу беспокоит, переходите на секс в презервативе и пусть она пролечится.
КСтати, она самолечением не занимается, случаем? А то разрекламированные вагинальные таблетки типа Тержинан и Полижинакс вполне могут давать дисбактериоз и последующий гарденеллез.