Как-то странно. Если это именно экселевский файл, то в нем должен храниться формат ячейки, который при открытии экселем же нормально читается и нули никуда не деваются.
Уверен, что к вам приходит именно экселевский файл? То, что у него эксель-образная иконка, еще ни о чем не говорит. Расширение у него какое? Сдается мне, что-то типа .csv

Короче, если я прав, первое, что можно сделать, попросить выслать файл в действительно экселевском формате:)
Ну а если не дают, или если можно получить файл в текстовом формате, тогда рекомендую скачать и установить пакет openoffice - он бесплатен. В нем одна из программ - calc - типа экселя. Открывая в нем файлы csv, txt - он сразу предлагает установить параметры экспорта. Выбираешь символ разделителя, далее надо выбрать нужные колонки и установить на них тип "текст", открыть, порадоваться и сохранить в экселевском формате

На самом деле параметрами экспорта можно играться и в самом экселе(не устанавливая openoffice), но calc предлагает панель экспорта сразу, а в экселе ее еще надо найти.