Вильнюс наименее интересный из трех прибалтийских столиц. ИМХО Но съездить можно.
Самым интересным мне показался Таллин.
С шенгенской визой имеет значение первое пересечение границы. Далее можно ездить по шенгену без проблем. Можно не возвращаться в Ригу, а вернуться прямо из Вильнюса, например.
Изредка дают национальную, а не шенгенскую визу. С ней нельзя перемещаться за пределы выдавшей страны. На границах внутри шенгена очень редко проверяют документы, но могут.