Журнала достаточно. Всё остальное имхо самодурство, которое тебе правильно не нравится.
Когда я работал в одной "голубой фишке" (гусары молчать!!!!

), то у нас просто были электронные пропуска и каждый проход через автомат фиксировался, а таких было много. Каждую неделю распечатка с проходной ложилась на стол начальникам отделов, и они, если того сами хотели, изучали её. Всё.
Журнал командировок тоже был. Но он имхо нужен - и в первую очередь, чтобы жопу начальству прикрыть, если что то с подчинённым случиться.

У меня, к примеру, было пару случаев, когда сотрудники попадали в ситуации за проходной (один даже помер), а это уже совсем другой коленкор.
И помни, что по закону прогулом считается отсутствие на рабочем месте без уважительных причин более 3-х часов.